Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms