Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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RIPK1Q13546 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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RIPK1Q13546 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.74□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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RIPK1Q13546 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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RIPK1Q13546 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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RIPK1Q13546 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
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RIPK1Q13546 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIPK1Q13546 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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