Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIPK1Q13546 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIPK1Q13546 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIPK1Q13546 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIPK1Q13546 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
RIPK1Q13546 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIPK1Q13546 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIPK1Q13546 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIPK1Q13546 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIPK1Q13546 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIPK1Q13546 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIPK1Q13546 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIPK1Q13546 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
RIPK1Q13546 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIPK1Q13546 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.82□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.81□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
RIPK1Q13546 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
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