Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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CLDN25C9JDP6 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
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CLDN25C9JDP6 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLDN25C9JDP6 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CLDN25C9JDP6 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CLDN25C9JDP6 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CLDN25C9JDP6 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CLDN25C9JDP6 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CLDN25C9JDP6 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CLDN25C9JDP6 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CLDN25C9JDP6 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CLDN25C9JDP6 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CLDN25C9JDP6 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CLDN25C9JDP6 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CLDN25C9JDP6 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CLDN25C9JDP6 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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