Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.6 ms