Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
DLL3Q9NYJ7 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DLL3Q9NYJ7 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.4 ms