Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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