Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms