Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
DDB1Q16531 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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