Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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