Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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