Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.8 ms