Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC74AQ96AQ1 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC74AQ96AQ1 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.9 ms