Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDB1Q16531 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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