Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CNN3Q15417 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CNN3Q15417 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CNN3Q15417 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CNN3Q15417 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNN3Q15417 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNN3Q15417 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNN3Q15417 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNN3Q15417 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CNN3Q15417 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CNN3Q15417 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CNN3Q15417 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CNN3Q15417 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNN3Q15417 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNN3Q15417 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNN3Q15417 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNN3Q15417 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNN3Q15417 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNN3Q15417 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNN3Q15417 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
CNN3Q15417 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNN3Q15417 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNN3Q15417 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNN3Q15417 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CNN3Q15417 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CNN3Q15417 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNN3Q15417 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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