Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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GRIK3Q13003 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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GRIK3Q13003 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIK3Q13003 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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