Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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DDB1Q16531 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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DDB1Q16531 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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DDB1Q16531 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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DDB1Q16531 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DDB1Q16531 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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