Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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CNN3Q15417 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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CNN3Q15417 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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CNN3Q15417 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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CNN3Q15417 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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CNN3Q15417 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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