Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.3 ms