Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.5 ms