Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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CNN3Q15417 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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CNN3Q15417 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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CNN3Q15417 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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CNN3Q15417 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
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CNN3Q15417 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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CNN3Q15417 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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CNN3Q15417 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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CNN3Q15417 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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CNN3Q15417 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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CNN3Q15417 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNN3Q15417 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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