Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK3Q13003 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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