Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DDB1Q16531 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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