Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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