Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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GRIK3Q13003 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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GRIK3Q13003 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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GRIK3Q13003 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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GRIK3Q13003 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK3Q13003 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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