Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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DDB1Q16531 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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