Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNN3Q15417 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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