Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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GRIK3Q13003 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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GRIK3Q13003 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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