Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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DDB1Q16531 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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DDB1Q16531 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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DDB1Q16531 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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DDB1Q16531 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDB1Q16531 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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