Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNN3Q15417 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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