Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
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