Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GRIK3Q13003 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIK3Q13003 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
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GRIK3Q13003 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIK3Q13003 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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