Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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