Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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