Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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PTPN13Q12923 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
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PTPN13Q12923 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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PTPN13Q12923 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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PTPN13Q12923 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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PTPN13Q12923 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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