Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNN3Q15417 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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