Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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COL9A2Q14055 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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COL9A2Q14055 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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COL9A2Q14055 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
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