Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme1P97371 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme1P97371 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psme1P97371 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms