Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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COL9A2Q14055 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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COL9A2Q14055 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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COL9A2Q14055 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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COL9A2Q14055 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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COL9A2Q14055 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
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COL9A2Q14055 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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COL9A2Q14055 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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COL9A2Q14055 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A2Q14055 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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