Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.6 ms