Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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COL9A2Q14055 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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COL9A2Q14055 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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COL9A2Q14055 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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COL9A2Q14055 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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COL9A2Q14055 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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COL9A2Q14055 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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COL9A2Q14055 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL9A2Q14055 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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