Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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COL9A2Q14055 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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COL9A2Q14055 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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COL9A2Q14055 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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COL9A2Q14055 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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COL9A2Q14055 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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COL9A2Q14055 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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COL9A2Q14055 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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