Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RAB33AQ14088 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.2 ms