Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
COL9A2Q14055 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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