Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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