Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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