Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme1P97371 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme1P97371 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psme1P97371 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psme1P97371 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psme1P97371 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme1P97371 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psme1P97371 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme1P97371 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme1P97371 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psme1P97371 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme1P97371 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme1P97371 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme1P97371 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psme1P97371 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms