Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct3P80318 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct3P80318 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms