Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm2aP59997 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2aP59997 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms