Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms